1.對於有募資需求且符合第二期投資方案目標對象者，可於本方案網站進行線上募資申請，填寫完成企業募資申請表後，專案辦公室將會進行電話訪談與初步個案評估，針對有潛力投資個案，也會提供募資計畫書範本以供申請企業參考。
2.當企業完備募資計畫書並回覆專案辦公室後，即正式列為受理個案，進入後續的投資評估及資源媒合作業。
3.除了直接向專案辦公室申請搭配投資外，亦可逕自向投資方案有搭配投資權利之投資人申請投資，後續則由搭配投資人進行投資評估作業。
線上申請募資可參「企業募資申請」頁面。
連結：企業募資申請
從企業申請搭配投資到實質取得投資資金所需時間，會受到企業營運發展想法、研發進程、營運里程碑達成情形與資訊提供的完整度等面向影響，估算短則半年、長則1~3年，須視企業狀況。
若符合第二期投資方案之投資對象，且有募資需求者，可於本方案網站進行線上募資申請，填寫完成企業募資申請表後，專案辦公室將依個案發展評估後，轉介搭配投資人或其他資源。
若搭配投資人推薦企業為搭配投資個案，進入到專案辦公室投前訪視階段，企業必需協助安排訪視會議，說明自身的營運發展歷程及未來發展規劃，協助經濟部中小企業處與訪視顧問瞭解及評估潛在搭配投資個案。
第二期投資方案原則個案單次投資上限為1億元，最多可增資至1.5億元；若增資後超過1億元時，將由專案辦公室辦理特別審議會評估。
專案辦公室及搭配投資人會依照中小企業所提出之募資計畫書進行投資評估審閱，主要評估面向：
1. 經營團隊過去實績與執行力
2. 產業趨勢與市場規模
3. 產品發展性與商品化程度
4. 技術或服務創新性
5. 市場與行銷可行性
6. 現行競爭者分析
7. 財務報表評估
8. 法務事項評估(包含取得相關認證、智財、訴訟等問題)
9. 募資結構與股權變動情形
10. 資金來源與運用合理性
11. 營運計畫書完整性與前後一致性
若企業過去曾獲國發基金創業天使投資方案投資者，考量資金挹注之階段別不同，企業仍得申請第二期投資方案，但仍需視搭配投資人及第二期投資方案評估決議搭配投資與否。
